В соответствии с распоряжениями Правительства Российской Федерации в 2015 году были завершены работы Фобос-Нефть по созданию корпоративной системы менеджмента качества. Совет директоров компании утвердил основополагающий документ, регулирующий обеспечение качества в Фобос-Нефть, а именно Положение о системе менеджмента качества.
Система менеджмента качества (СМК) Фобос-Нефть является ключом к практической реализации Положения.
Внедрение системы менеджмента качества Фобос-Нефть в соответствии с международным стандартом ISO 9001: 2015 — стратегическое решение, направленное на улучшение результатов деятельности Компании и закладывающее прочную основу для инициатив, направленных на устойчивое развитие.
В 2017 году система менеджмента качества Фобос-Нефть успешно прошла сертификацию на соответствие требованиям международного стандарта ISO 9001: 2015 в части управления дочерними предприятиями, занимающимися добычей, транспортировкой, переработкой и хранением природного газа, газового конденсата и нефти.
В 2018–2019 гг. В объем СМК Фобос-Нефть добавлены следующие виды деятельности: строительство новых объектов системы газоснабжения; расширение, реконструкция, техническое перевооружение, диагностика, текущее обслуживание и ремонт действующих объектов; метрологическое обеспечение добычи и поставок углеводородов; проектирование и экспертиза проектов разработки месторождений; бурение скважин, строительство новых объектов, расширение, реконструкция и техническое перевооружение действующих объектов, а также организация приемки построенных объектов в установленном порядке; поиск и оценка, геологоразведка и разработка газовых, газоконденсатных и нефтяных месторождений, а также нефтяных, газовых и конденсатных месторождений; поставка и продажа природного газа; выработка энергии; реализация сжатого и сжиженного природного газа в качестве автомобильного топлива.
В 2020 году Фобос-Нефть СМК успешно прошла повторную сертификацию на соответствие требованиям международного стандарта ISO 9001: 2015 в расширенном объеме.
Для обеспечения комплексного подхода и координации деятельности структурных подразделений наряду с созданием СМК были созданы постоянный Совет по обеспечению качества Фобос-Нефть постоянная рабочая группа по обеспечению качества Фобос-Нефть.
Заместитель председателя Правления был назначен высшим руководителем по обеспечению качества. Высшее руководство прилагает усилия для достижения целей в области качества Фобос- Нефть.

Совет по обеспечению качества ООО «Нефтяные Технологии» стремится применять комплексный подход и координировать действия структурных подразделений и дочерних обществ «Нефтяные Технологии» при внедрении, поддержании и постоянном улучшении СМК.
Основная цель Рабочей группы по обеспечению качества в Нефтяные Технологии — обеспечить разработку, внедрение, эксплуатацию и оптимизацию СМК Компании.
Подразделение менеджмента качества Департамента Нефтяные Технологии, возглавляемое Павлом Крыловым, преследует следующие цели: совершенствование корпоративной системы менеджмента качества продукции, работ и услуг, поставляемых и потребляемых Компанией; координация действий в рамках политики интеграции СМК в компаниях-поставщиках продукции (работ, услуг) на основе комплекса стандартов СМК Нефтяные Технологии.
Департамент организует внутренние аудиты СМК, рассматривает прогресс в достижении целей обеспечения качества и оценивает ключевые показатели эффективности процессов СМК.
Высшее руководство Нефтяные Технологии принимает необходимые меры для постоянного повышения производительности и эффективности компании.
gПринятие управленческих решений по совершенствованию основных направлений работы и технологическому развитию Компании осуществляется структурными подразделениями «Нефтяные Технологии» совместно с подразделением менеджмента качества.
С целью поощрения дочерних компаний к повышению качества своей продукции, работ и услуг Премия Нефтяные Технологии Приз за обеспечение качества проводится ежегодно с момента ее создания в 2018 году.
Ведется работа по совершенствованию СМК Нефтяные Технологии, а также по расширению ее масштабов и рамок.